Ponen orden al 'big data' genómico del cáncer de colon

Actualizado: martes, 13 octubre 2015 11:48

Primer paso para la personalización del tratamiento

   BARCELONA, 13 Oct. (EUROPA PRESS) -

   Un consorcio internacional ha establecido una clasificación genómica pionera para los tumores del cáncer colorectal (CCR) a partir del análisis de 4.000 muestras de pacientes que ha permitido definir cuatro subtipos e identificado las características biológicas de los tumores.

  CÁNCER DE COLON

   Esta investigación colaborativa, publicada en la revista 'Nature Medicine', ha sido coordinado por el Grupo de Ciencia de Datos en Oncología (Oncology Data Science, ODysSey) del Vall d'Hebron Institut d'Oncologia (VHIO) y el SAGE Bionetworks de Seattle, han informado en un comunicado.

   En declaraciones a Europa Press, el investigador principal del Grupo ODysSey y primer autor de la publicación, Rodrigo Dienstmann, ha explicado que esta clasificación es "el primer paso" para personalizar el tratamiento del cáncer de intestino en un futuro.

   "Hacía falta un consenso para la clasificación molecular o genómica", porque hasta ahora los investigadores trabajaban por separado con muestras de pocos pacientes, por lo que no obtenían resultados consistentes sobre los grupos, y se dificultaba la aceptación de la comunidad científica.

   Esta situación ha llevado a los oncólogos a unir esfuerzos a través de un consorcio internacional para sumar muestras, conocimiento de la biología y evolución del cáncer colorectal y competencia para hacer análisis 'big data' --datos masivos--.

   El VHIO y el SAGE Bionetworks han diseñado, con la ayuda de expertos informáticos, un algoritmo a partir del Big Data que ha determinado estos cuatro subtipos de tumor intestinal, que "biológicamente es como su fueran cuatro tumores distintos", ha apuntado Dienstmann.

GRUPOS CONSENSUADOS

   Los subtipos acordados son el Consensus Molecular Subtypes (CMS), que supone el 15% de los tumores y está caracterizado por tener una potente activación inmunológica, y el CMS2 --40% de los casos--, que es el grupo con más inestabilidad cromosómica y el que sigue la carecinogenesis clásica.

   También se han determinado el CMS3 --15% de tumores--, caracterizado por tener desregulación de las vías metabólicas asociadas a la mutación de un gen, y el CMS4 --30% de los tumores--, que presenta un pronóstico muy poco favorable con el tratamiento estándar.

TRATAMIENTOS MÁS PERSONALIZADOS PARA EL CÁNCER COLORRECTAL

   Esta clasificación se aplica a nivel preclínico --investigación--, pero está previsto desarrollar un test clínico en 2016 para los hospitales, lo que permitiría hacer un análisis de expresión de los genes, clasificar tumores según el subtipo y elegir el tratamiento más beneficioso.

   Esta clasificación permitirá mejorar el diagnóstico y aplicar un tratamiento más personalizado, un factor determinante en la mortalidad de los pacientes, puesto que la supervivencia depende del estadio de la enfermedad.

   Si los tumores se detectan en estadio muy precoz a través por ejemplo de cribados --colonoscopia-- el cáncer es curable en un 90-95% de los casos; cuando hay metástasis en los ganglios la supervivencia es del 70-80%, y si la metástasis llega a otros órganos la supervivencia es de 2 o 3 años.

   La investigación ha sido impulsada por Obra Social La Caixa a través del programa La Caixa International Program for Cancer Research and Education, y también ha contado con la participación del director del VHIO y coautor del trabajo, Josep Tabernero, de del Institut Català d'Oncologia (ICO), Ramon Salazar.